Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LETMD1Q6P1Q0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms