Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF6Q6KF10 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms