Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUPD1Q68J44 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUPD1Q68J44 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms