Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX8Q68G74 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms