Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF43Q68DV7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF43Q68DV7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms