Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF3Q5VWG9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms