Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
EFCAB2Q5VUJ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
EFCAB2Q5VUJ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms