Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4DIPQ5VU43 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DIPQ5VU43 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms