Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms