Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PERM1Q5SV97 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PERM1Q5SV97 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms