Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HP1BP3Q5SSJ5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HP1BP3Q5SSJ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms