Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC39AQ5SRH9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms