Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A3Q5K4L6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC27A3Q5K4L6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC27A3Q5K4L6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms