Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EFHC1Q5JVL4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHC1Q5JVL4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms