Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC4Q5GLZ8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms