Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms