Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SP6Q3SY56 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms