Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms