Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NDUFA9Q16795 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NDUFA9Q16795 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms