Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDK4Q16654 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK4Q16654 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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