Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTRK2Q16620 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK2Q16620 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms