Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM1Q16610 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM1Q16610 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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