Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA3Q16281 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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CNGA3Q16281 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA3Q16281 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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