Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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