Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF1Q15637 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF1Q15637 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF1Q15637 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF1Q15637 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF1Q15637 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF1Q15637 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF1Q15637 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF1Q15637 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF1Q15637 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SF1Q15637 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SF1Q15637 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF1Q15637 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF1Q15637 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF1Q15637 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF1Q15637 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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