Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HERC3Q15034 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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