Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HDM1Q15032 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HDM1Q15032 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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