Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCLAFQ15004 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCLAFQ15004 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCLAFQ15004 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCLAFQ15004 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCLAFQ15004 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCLAFQ15004 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCLAFQ15004 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCLAFQ15004 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCLAFQ15004 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCLAFQ15004 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCLAFQ15004 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCLAFQ15004 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCLAFQ15004 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCLAFQ15004 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCLAFQ15004 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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