Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GAPVD1Q14C86 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
GAPVD1Q14C86 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
GAPVD1Q14C86 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
GAPVD1Q14C86 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
GAPVD1Q14C86 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36■■■■□ 3.35
GAPVD1Q14C86 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GAPVD1Q14C86 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
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