Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF1Q14990 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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