Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPNMBQ14956 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPNMBQ14956 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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