Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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IRF3Q14653 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF3Q14653 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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IRF3Q14653 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF3Q14653 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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