Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL4A6Q14031 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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