Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP5Q14008 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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