Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PMS2P11Q13670 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PMS2P11Q13670 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PMS2P11Q13670 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P11Q13670 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P11Q13670 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P11Q13670 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms