Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTCH1Q13635 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTCH1Q13635 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTCH1Q13635 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
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