Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPP1R1AQ13522 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPP1R1AQ13522 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms