Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPC3Q13507 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC3Q13507 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC3Q13507 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
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