Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PICALMQ13492 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PICALMQ13492 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PICALMQ13492 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
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