Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD4Q13485 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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