Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 518.2■□□□□ 0.52e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 DDB1-215ENST00000539712 1020 ntTSL 220.75■□□□□ 0.911e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.082e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 UQCRC1-203ENST00000415995 1387 ntTSL 519.89■□□□□ 0.772e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MTR-205ENST00000535889 10405 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.284e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MTR-201ENST00000366576 5234 ntTSL 1 (best)13.14□□□□□ -0.314e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.354e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 TPM3-202ENST00000302206 741 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 TPM3-221ENST00000513769 539 ntTSL 312.18□□□□□ -0.461e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 TPM3-213ENST00000368545 2147 ntTSL 1 (best)10.62□□□□□ -0.711e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 TJP2-211ENST00000636247 3725 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.093e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 PSMD11-207ENST00000578397 1178 ntTSL 217.24■□□□□ 0.358e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 AHSA1-211ENST00000556866 432 ntTSL 22.85□□□□□ -1.951e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 NUDC-203ENST00000452707 816 ntTSL 327.66■■■□□ 2.023e-11■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.36□□□□□ -1.871e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 EFTUD2-217ENST00000590124 899 ntTSL 324.64■■□□□ 1.541e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 PSMD11-210ENST00000584340 559 ntTSL 413.32□□□□□ -0.286e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 CTNNA1-227ENST00000521387 871 ntTSL 28.49□□□□□ -1.051e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 APEX1-218ENST00000557344 671 ntTSL 212.37□□□□□ -0.432e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 UTRN-207ENST00000432686 666 ntTSL 38.41□□□□□ -1.062e-11■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 UTRN-205ENST00000417142 678 ntTSL 35.52□□□□□ -1.532e-11■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 UTRN-209ENST00000455022 633 ntTSL 35.47□□□□□ -1.532e-11■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 LARP1-203ENST00000518194 450 ntTSL 514.26□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 LMO7-214ENST00000524651 914 ntTSL 316.98■□□□□ 0.312e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.162e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.435e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 NARS-207ENST00000587675 1002 ntTSL 220.59■□□□□ 0.893e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 NARS-212ENST00000591599 584 ntTSL 515.09■□□□□ 0.013e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 NARS-208ENST00000588661 582 ntTSL 512.83□□□□□ -0.363e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.42e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-225ENST00000636808 2639 ntTSL 521.84■■□□□ 1.092e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.382e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-224ENST00000636743 2332 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-226ENST00000636872 2747 ntTSL 515.29■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-221ENST00000636225 1738 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-205ENST00000458249 2037 ntTSL 513.87□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-228ENST00000636886 2321 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-232ENST00000637272 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-216ENST00000635851 2135 ntTSL 512.48□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-231ENST00000637206 2466 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-236ENST00000638008 1865 ntTSL 511.52□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-227ENST00000636879 2501 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 EIF4A1-206ENST00000577929 696 ntTSL 223.21■■□□□ 1.316e-10■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 EIF4A1-219ENST00000581770 447 ntTSL 216.99■□□□□ 0.316e-10■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 EIF4A1-205ENST00000577738 531 ntTSL 215.94■□□□□ 0.146e-10■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 GLUL-210ENST00000484996 1369 ntTSL 325.95■■□□□ 1.756e-9■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 EIF3G-210ENST00000590158 1034 ntTSL 219.51■□□□□ 0.715e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 USP11-208ENST00000480104 697 ntTSL 314.27□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 HUWE1-209ENST00000474288 1254 ntTSL 213.11□□□□□ -0.313e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 HECTD1-214ENST00000556281 684 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.474e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.072e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.072e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.742e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.462e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.122e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-8■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.865e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.455e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.285e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.555e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.225e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.175e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.165e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 MAGED2-202ENST00000347546 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.255e-7■■■□□ 15.5
G3BP1Q13283 EFTUD2-219ENST00000590977 2422 ntTSL 211.33□□□□□ -0.61e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 UQCRC1-209ENST00000480561 1014 ntTSL 217.59■□□□□ 0.411e-7■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ACY1-218ENST00000637034 745 ntTSL 319.24■□□□□ 0.676e-7■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 TPM3-219ENST00000509409 1248 ntTSL 219.04■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 29.15□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.044e-7■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 UBAP2L-211ENST00000456325 812 ntTSL 321.61■■□□□ 1.053e-7■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 PHGDH-204ENST00000469443 653 ntTSL 222.62■■□□□ 1.211e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 GORASP2-206ENST00000471559 812 ntTSL 410.41□□□□□ -0.742e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 AC010132.3-202ENST00000433579 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 228.26■■■□□ 2.112e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 PSMA2-201ENST00000223321 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 PSMA2-203ENST00000436986 1453 ntTSL 310.61□□□□□ -0.712e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 PSMA2-205ENST00000457444 801 ntTSL 310.05□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.562e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.962e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-222ENST00000582991 2152 ntTSL 520.97■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-203ENST00000395575 3640 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-202ENST00000339618 3828 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-206ENST00000472059 3710 ntTSL 212.99□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 ALDH3A2-207ENST00000476965 1383 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 15.4
G3BP1Q13283 SEC23A-205ENST00000553925 484 ntTSL 34.52□□□□□ -1.691e-13■■■□□ 15.4
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 126.4 ms