Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ERCC8Q13216 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ERCC8Q13216 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ERCC8Q13216 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ERCC8Q13216 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ERCC8Q13216 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ERCC8Q13216 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ERCC8Q13216 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ERCC8Q13216 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ERCC8Q13216 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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