Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDC16Q13042 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC16Q13042 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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