Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK2Q13002 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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