Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFX1Q12986 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFX1Q12986 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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