Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXF2Q12947 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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