Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFSWAPQ12872 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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