Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNMA1Q12791 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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