Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCAPQ12770 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPQ12770 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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