Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 PTM1YKL039W 1572 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 URA2YJL130C 6645 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YGR149WYGR149W 1299 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 JLP1YLL057C 1239 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 UBC12YLR306W 567 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 ATG16YMR159C 453 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 ATG29YPL166W 642 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 MDM38YOL027C 1722 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 RRP14YKL082C 1305 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 SRO9YCL037C 1305 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 CDC6YJL194W 1542 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 NGL3YML118W 1518 nt4.11□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 NPL4YBR170C 1743 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YDL157CYDL157C 357 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 RPA14YDR156W 414 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 RNH202YDR279W 1053 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YHR173CYHR173C 339 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 PAM18YLR008C 507 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 ERV41YML067C 1059 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YOR338WYOR338W 1092 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 GRX1YCL035C 333 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 RNA14YMR061W 2034 nt4.1□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 NSP1YJL041W 2472 nt4.09□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 FAP7YDL166C 594 nt4.09□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 AIM6YDL237W 1173 nt4.09□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt4.09□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 RUF20RUF20 443 nt4.09□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 RPS10BYMR230W 318 nt4.09□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 MUM2YBR057C 1101 nt4.09□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 FLO10YKR102W 3510 nt4.09□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 GPI1YGR216C 1830 nt4.09□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 UBC8YEL012W 657 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 PRP22YER013W 3438 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YGL132WYGL132W 336 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 MRPS35YGR165W 1038 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 RAD2YGR258C 3096 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 DCG1YIR030C 735 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YJR037WYJR037W 384 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YMR1YJR110W 2067 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 LTV1YKL143W 1392 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YKL177WYKL177W 339 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 HYM1YKL189W 1200 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 ERD2YBL040C 660 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 TMA16YOR252W 537 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YBR137WYBR137W 540 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 DRS2YAL026C 4068 nt4.08□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 GCD1YOR260W 1737 nt4.07□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt4.07□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 MDJ2YNL328C 441 nt4.07□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 TIR2YOR010C 756 nt4.07□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 PNT1YOR266W 1272 nt4.07□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 CDC9YDL164C 2268 nt4.07□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 GPB1YOR371C 2694 nt4.07□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 PKH1YDR490C 2301 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 ALR2YFL050C 2577 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YCR015CYCR015C 954 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YCR101CYCR101C 549 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 PAN5YHR063C 1140 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YAE1YJR067C 426 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 RPS21AYKR057W 264 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 COX19YLL018C-A 297 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 RAD33YML011C 534 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 RNA1YMR235C 1224 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 DIA1YMR316W 1011 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 ASI2YNL159C 870 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YPR142CYPR142C 564 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 NUP159YIL115C 4383 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 ALG11YNL048W 1647 nt4.06□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 RTS1YOR014W 2274 nt4.05□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 PEX21YGR239C 867 nt4.05□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 HOT13YKL084W 351 nt4.05□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 RPF2YKR081C 1035 nt4.05□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YLR169WYLR169W 354 nt4.05□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 GIS2YNL255C 462 nt4.05□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 DCP1YOL149W 696 nt4.05□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 INA17YPL099C 549 nt4.05□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 snR17asnR17a 333 nt4.05□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 IOC4YMR044W 1428 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 BUD5YCR038C 1929 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 PDX1YGR193C 1233 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 BCD1YHR040W 1101 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 ARG3YJL088W 1017 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 ARC19YKL013C 516 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 MTD1YKR080W 963 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YNL319WYNL319W 441 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YOR342CYOR342C 960 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 PEP7YDR323C 1548 nt4.04□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 MIH1YMR036C 1665 nt4.03□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 PHO13YDL236W 939 nt4.03□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 PHM6YDR281C 315 nt4.03□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 AIM23YJL131C 1071 nt4.03□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt4.03□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 YOR314WYOR314W 330 nt4.03□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 BMT2YBR141C 1014 nt4.03□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 CHA4YLR098C 1947 nt4.03□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 RKM3YBR030W 1659 nt4.03□□□□□ -1.76
LSP1Q12230 SRS2YJL092W 3525 nt4.03□□□□□ -1.76
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